Организация 14 февраля 2024 года подала уточненную декларацию по НДС за IV квартал 2020 года с суммой возмещения. В более ранних налоговых периодах она применила вычет по авансовому счету-фактуре от 10 апреля 2020 года, но не заявила его по счету-фактуре от 18 декабря 2019 года. В IV квартале 2020 года она ошибочно восстановила НДС по обоим счетам-фактурам.

Инспекция посчитала, что заявление НДС к возмещению неправомерно, поскольку прошло более 3 лет по окончании налогового периода.

Суды с проверяющими не согласились:

• уменьшение базы может привести к увеличению возмещения или к излишней уплате налога;
• оба этих механизма – возмещение налога и возврат переплаты – идентичны;
• организация не заявляла вычеты за пределами 3 лет. Налог к возмещению не связан с новыми вычетами. Все вычеты она ранее включила в декларацию за IV квартал 2020 года в пределах 3 лет. Право на вычет тогда налоговики подтвердили;
• ошибка в виде завышения базы привела к излишнему исчислению налога (возмещению в меньшем размере), что не нарушает интересов казны РФ;
• срок для исправления ошибки исчисляют с момента излишнего восстановления НДС;
• правило о 3-летнем сроке к этой ситуации применять нельзя, поскольку исправление ошибки, из-за которой излишне исчислена база, не связано с корректировкой вычетов в сторону их увеличения.